GBIF.orgを通して利用可能なデータおよび関連サービスは、世界中の何百もの機関から引き出された何千もの異なるデータセットを記述し、記録し、構造化するための共有ルールおよび規則をGBIFネットワークの参加団体およびデータ発行者が適用してきたことによる成果です。共通の標準形式のおかげで、GBIFインデックスにおいて何億もの生物多様性情報の一次レコードを集めることに成功しました。
生物多様性分野において、標準データ形式の開発および維持を主に担っている団体はBiodiversity Information Standardsです。この非営利な科学・教育協会は、International Union of Biological Scienceの関係団体として生物および生物多様性データ交換のための標準データ形式の開発に焦点を当てています。生物多様性コミュニティのメンバーはこの団体をTDWG（タドウィグと発音）と呼んでいます（団体の前身であるTaxonomic Databases Working Groupを思い起こす意味も込めて）。
よく使われる標準形式
ダーウィンコア
ダーウィンコアスタンダード（DwC）は、多様で変化する情報源から生物多様性データを集める上で安定した、直接的で柔軟なフレームワークを提供します。GBIF.orgで共有されているデータセットの多くはダーウィンコアアーカイブフォーマット（DwC-A）を用いて出版されています。
• ダーウィンコアとは何ですか？なぜ重要なのですか？
• サンプリングイベントデータの紹介
• iOBISダーウィンコアマニュアル
• ダーウィンコアの用語（Gcube Wiki経由）
EML：生態学メタデータ言語
生態学メタデータ言語またはEMLとは、生態学分野のデータセットに関する情報を記述するためのメタデータ標準であり、モジュール式で拡張されたXMLドキュメントタイプの一つです。GBIF.orgにおけるデータセットの全ての記述はメタデータに準拠しています。メタデータとはデータについての情報で、The Knowledge Network for Biocomplexityにより維持管理されているオープンソースのEML標準形式を使用しています。ダーウィンコアアーカイブは構成ファイルの一つとして（EML形式で記述された）EMLファイルを含みます。
• GBIFメタデータプロファイル：ハウツーガイド
• EML標準形式
BioCASe / ABCD
Biological Collection Access Serviceは、一般的にはBioCASeと呼ばれ、自然史博物館、植物園、動物園および研究機関から集められた生物コレクションデータをつなぐ国際ネットワークです。BioCASeは同じくTDWGが管理するAccess to Biological Collections Data (ABCD) data exchange standardに準拠しています。